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学科组长:方勤 研究员

Qin Fang,  Ph.D

Senior Scientist,  PI

 

    方勤,博士,中国科学院武汉病毒研究所研究员。曾先后开展过HBV诊断试剂的研制与开发应用,卡波氏肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)分子流行病学研究等工作。承担并完成多项国家自然科学基金研究项目、中国科学院创新课题及国家重点基础研究项目973课题。在国内外核心刊物发表研究论文50余篇。申请国家专利5项,获国家授权专利4项,合编专著3部,其中英文专著1部。长期以来,一直从事草鱼呼肠孤病毒(GCRV)基础生物学与分子生物学的系统研究。2000年在国际上首次报道GCRV与哺乳动物呼肠孤病毒MRV在基因组水平进化上具有高度的同源性;近年来,在GCRV高分辨率结构研究方面取得一些突破性研究进展,代表论文:BBRC, 2000, 274(3): 762-766; Science in China Ser. C Life Sciences,48:593-600; JMB, 2010, 397: 852-863, Cell, 2010, 141:472-482。目前主要研究方向为GCRV衣壳蛋白结构与功能及病毒非结构蛋白在复制与组装中的功能研究。

专访方勤:Cell文章中的病毒学突破性发现

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Introduction Introduction

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        双链RNA病毒能广泛感染自然界中各种生物有机体,其宿主范围包括脊椎动物、无脊椎动物、植物、真菌与微生物等,并导致机体产生各种病理反应。基于国际病毒分类命名委员会第九次报告,dsRNA病毒包括8大家族。呼肠孤病毒科为dsRNA病毒中最为庞大的家族,目前至少有15个属成员组成。草鱼呼肠孤病毒(Grass Carp Reovirus, GCRV)为中国分离鉴定的第一株水生动物病毒, GCRV隶属于呼肠孤病毒科水生呼肠孤病毒属。GCRV为二十面体立体对称的无包膜球形颗粒,具有5-3-2次立体对称结构, 其11条分段的dsRNA基因组包含在病毒核衣壳内。病毒基因组编码7种结构蛋白和5种非结构蛋白。成熟病毒粒子由7种结构蛋白(VP1-VP7)组成,其中VP1-VP4和VP6组成病毒核衣壳,而外衣壳则由200个VP5和VP7异源三聚体组成。 

           Double stranded (ds) RNA viruses, which affect a very wide range of host species including vertebrates, invertebrates, plants, fungi, and prokaryotes,represent a diverse group of viral pathogens. According to classification of the International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV), eight distinct families are currently recognized.The Reoviridae, one of the most complex families in dsRNA group, consists of at least 15 distinct genera reported so far.  Grass carp reovirus (GCRV), a member of genus Aquareovirus in the family Reoviridae, was the first viral pathogen to be identified from aquatic animals in China. The virus is a nonenveloped icosahedral spherical in appearance with 5:3:2 three-dimensional symmetry, which is comprising 11 double-stranded RNA genome segments surrounded by multiple concentric protein capsids . The 11 genome segments encode seven structural proteins (VP1-VP7) and five nonstructural proteins. The core layer is composed of 5 proteins (including VP1-VP4 and VP6),while the outer capsid of GCRV contains 200 trimers formed by VP5-VP7 heterodimers.

  

GCRV 3D结构图