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             石正丽

             研究员

          博士生导师

现为中科院新发和烈性病原与生物安全重点实验室主任、武汉病毒所新发传染病研究中心主任、武汉国家高等级生物安全实验室(P4)副主任和生物安全3级实验室主任。

 现任《病毒学报》编委、《中国病毒学》编委;中国微生物学会病毒专业委员会委员。

石正丽研究员1987年7月毕业于武汉大学生物系遗传专业,获学士学位。1990年7月毕业于中科院武汉病毒所,获硕士学位。2000年5月获法国蒙彼利埃(Montpellier)第二大学博士学位。长期从事新发病毒的研究,在病毒的分离和鉴定、病毒的遗传进化、病毒的检测技术、病毒的分子流行病学等方面有长期的积累和研究经验。

主要贡献有:在蝙蝠体内发现遗传多样的SARS样冠状病毒,并首次成功分离到与SARS病毒高度同源的蝙蝠冠状病毒,证明蝙蝠是SARS冠状病毒的自然宿主,揭示了SARS病毒从蝙蝠到人的生态传播链(Science, 2005; Nature, 2013);在我国蝙蝠体内检测到烈性病毒尼帕病毒和埃博拉病毒的抗体,为蝙蝠病毒引起的烈性新发传染病的预防提供了预警策略(Emerging Infectious Disease , 2008; Virology Journal, 2012);首次解析了2种蝙蝠的基因组序列,提示蝙蝠具有独特的抗病毒免疫特征,为后续研究蝙蝠抗病毒免疫机制提供了基础(Science , 2013);在蝙蝠体内检测到遗传多样的腺病毒、腺相关病毒和圆环病毒,进一步证实蝙蝠是多种病毒的自然宿主(Journal of Virology, 2010; Journal of General Virology, 2010和2011)。

目前承担有国家973、国家自然科学基金重大项目等课题。

代表性论文:

J Virol. 2016.  Bat SARS-like coronavirus WIV1 encodes an extra accessory protein ORFX involved in modulation of host immune response.

J Virol. 2016. Isolation and characterization of a novel bat coronavirus closely related to the direct progenitor of SARS coronavirus.

Nature,2013,Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the ACE2 receptor.

Science, 2013, Comparative Analysis of Bat Genomes Provides Insight into the Evolution of Flight and Immunity;

Science, 2005, Bats are natural reservoirs of SARS-like coronaviruses;

JV, 2013, Deep RNA Sequencing Reveals Complex Transcriptional Landscape of a Bat Adenovirus;

JV, 2012, Metagenomic Analysis of Viruses from Bat Fecal Samples Reveals Many Novel Viruses in Insectivorous Bats in China;

JV, 2010, Host Range, Prevalence and Genetic Diversity of Adenoviruses in Bats;

JV, 2008, Difference in receptor usage between SARS coronavirus and SARS-like coronavirus of bat origin.  

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学科组简介 学科组简介

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以新发病毒病原学及其感染机理为主要研究方向,包括病毒的分离、鉴定、早期诊断技术的建立和基因组研究;动物源传染性病毒分子流行病学和跨物种感染的分子机理(如SARS样冠状病毒、尼帕病毒、汉坦病毒等);特定生境(动物以及环境)中病毒宏基因组研究。

 

本学科组目前共有工作人员11人,在读硕博士研究生16人。自2004年开始研究蝙蝠携带的人类传染性病毒如SARS冠状病毒、尼帕病毒、埃博拉病毒、汉坦病毒的分子流行病学及其跨种感染的分子机理的研究,在蝙蝠体内发现了多株不同基因型的、与SARS病毒基因组高度相似的SARS样冠状病毒,为SARS病毒的动物溯源提供了新的证据。SARS 病毒暴发后,我们在蝙蝠体内相继检测到遗传多样的SARS 样冠状病毒、尼帕病毒抗体、腺病毒、星状病毒、小RNA 病毒、腺相关病毒、圆环病毒、呼肠孤病毒等等,证明我国蝙蝠也携带有种类多样的病毒。近期,由5个国家9个实验室组成的联合研究团队解析了2种蝙蝠的全基因组序列。这2种蝙蝠分别来自澳大利亚的大蝙蝠狐蝠和中国的小蝙蝠大卫鼠耳蝠。分析结果提供了蝙蝠飞行、免疫系统及其它独特生物学特性的适应性进化的生物信息学证据。

现阶段我们的主要研究内容包括:

1)人类已知重要病原在蝙蝠种群的分布和遗传进化研究:重要烈性传染性病毒如SARS 病毒、埃博拉病毒和汉坦病毒等在蝙蝠体内的感染情况,包括病原核酸和血清学检测、基因组和遗传变异、与人类已知病原的血清学和分子进化关系等。

2)常见病毒病原在蝙蝠种群的分布和遗传进化研究:常见病毒病原如冠状病毒、副粘病毒、星状病毒、腺病毒、圆环病毒、小RNA 病毒、细小病毒、呼肠孤病毒等在蝙蝠体内的感染情况,包括病原核酸检测、基因组和遗传变异、与人类已知病原的血清学和分子进化关系等。

3)蝙蝠病毒宏基因组学分析:研究不同种群蝙蝠呼吸道和肠道病毒宏基因组学,比较分析不同种群携带或传播的病毒谱差异,研究不同蝙蝠种群在传播病毒中的作用。

4)蝙蝠病毒的分离和鉴定及其细胞嗜性研究:分离蝙蝠新病毒,从细胞水平和动物水平研究新分离的蝙蝠病毒对人畜的潜在致病性。包括不同来源的细胞敏感性研究、模型动物感染、组织嗜性和感染途径的研究等。

5)蝙蝠新病毒与人类疾病的关系研究:建立新发现的蝙蝠病毒的血清学和分子诊断技术,收集蝙蝠栖息地周边人群疾病谱信息和血清样本,检测蝙蝠新病毒在人群中的感染情况,利用生物统计学分析蝙蝠携带的病毒与人类已知疾病和未知疾病的关系。同时选择几种与人类疾病关系密切的蝙蝠病毒,监测其在蝙蝠种群中的动态和时空分布,分析其与人类疾病流行的关系。

6)蝙蝠抗病毒免疫研究:主要开展蝙蝠抗病毒天然免疫通路以及比较病毒感染人和蝙蝠后引起的免疫反应异同等研究。