学科组长 学科组长

最小化 最大化

     

龚鹏

研究员  博士生导师

        中国科学院“百人计划”入选者,病毒基因组复制结构生物学学科组组长。1998年及2001年于清华大学化学系获得学士及硕士学位。2006年于美国马萨诸塞大学(University of Massachusetts Amherst)获博士学位,期间主要研究转录过程中RNA聚合酶由链初始到链延长的转换机制。2006年至2011年先后在马萨诸塞大学和美国科罗拉多州立大学(Colorado State University)从事与转录相关的DNA修复以及RNA病毒基因组复制的相关研究,主要研究手段为生物大分子单晶X-射线晶体学及生物化学。近期在正义RNA病毒聚合酶领域的阶段性成果发表在国际知名综合性刊物PNAS上,所解析出的一系列高分辨率聚合酶-RNA复合物晶体结构揭示了同类病毒聚合酶催化循环中数个关键步骤的机理及活性中心关闭的独特模式,为针对这类病毒聚合酶的药物开发提供了结构学基础。
 
代表性论文:
 

学科组简介 学科组简介

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        本学科组成立于2011年底,经过一年的努力,以X-射线晶体学为主要研究手段的实验平台已从头搭建完成,包括大规模蛋白纯化系统、大规模RNA制备系统、蛋白质晶体生长系统。本学科组目前有研究员1名,副研究员1名,实验员2名,在读博士研究生3人,硕士研究生3名。学科组主要致力于重要人类致病病毒的RNA依赖的RNA聚合酶(RdRP)及其复合物的结构解析。与此同时,生物化学及生物物理的相关方法将被应用到不同的RdRP体系中,以期能将结构和功能的研究紧密地结合起来。
 
        学科组主要研究在RNA合成机理上具有代表性的两类RdRP:第一类包括属于黄病毒科的丙型肝炎病毒(HCV)、日本脑炎病毒(JEV)和西尼罗病毒(WNV)的RdRP,这类聚合酶在RNA合成的初始阶段采用从头合成方式(de novo initiation),并需要经历较大幅度的构象变化而达到稳定的链延长阶段。第二类包括属于小核糖核酸病毒科的肠道病毒71型(EV71)和甲型肝炎病毒(HAV)RdRP,此类聚合酶采用依赖引物的(primer-dependent)合成方法,不需大幅度构象变化即可到达链延长阶段。针对这两类RdRP的特点,本实验室所采取的策略是从多个RdRP体系入手,找到较好的切入点,解析未知的RdRP晶体结构,组装链延长阶段复合物并进行结构与功能研究,探究其中的构象变化,循序渐进地推动对这类RdRP的了解。

研究方向 研究方向

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        本学科组主要致力于正链RNA病毒基因组复制机理的研究,解析与复制相关蛋白质及其复合物的高分辨率X-射线晶体结构,并结合传统的酶学研究从分子水平上提高对病毒基因组复制的整体认识,从而为抗病毒药物的研发提供重要的理论依据。
 
 

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